در این مطالعه شناسائی و ترکیب گروههای فیتوپلانکتون، زئوپلانکتون، کفزیان و ماهیان دریاچه قلعه چای در سال 1390 انجام گردید. براساس نتایج، 27 گروه فیتوپلانکتونی شامل دیاتوم ها (10 جنس)، کلروفیتا (11 جنس)، سیانوفیتا (3 جنس)، اوگلنوفیتا (2 جنس) و داینوفلاژلا (1 جنس) شناسائی گردیدند. شاخه های دیاتوم ها و کلروفیتا از نظر تعداد جنس های فیتوپلانکتون غالب بودند. از گروه زئوپلانکتون 23 جنس از 4 شاخه شامل Arthropoda (کوپه پودا 2 جنس و کلادوسرا 2 جنس)، Protozoa (5 جنس)، Rotatoria (14 جنس) شناسائی شدند. بیشترین گروه متعلق به شاخه Rotatoria بوده است. شش گروه Ephemeroptera ,Chironomidae , Heptagenidae , Beatidae ,Simulidae, Tubificidae و Hydropsychidae در بررسی کفزیان دریاچه قلعه چای مشاهده شدند. در بررسی ماهیان، 9 گونه ماهی از خانواده های Cyprinidae (8 گونه) و Nemacheilidae (1 گونه) مورد شناسایی قرار گرفت. از بین این ماهیان، چهار گونه ی مروارید ماهی قفقاز (Alburnus atropatenae) ، سس ماهی کورا (Barbus lacerta)، سیاه ماهی معمولی(Capoeta capoeta) و رفتگرماهی(.Oxynoemacheilus sp) از ماهیان بومی منطقه بوده اند. براساس یافته ها گروههای پلانکتونی شناسایی شده دریاچه قلعه چای بیانگر دارا بودن کیفیت آب نسبتا پاکیزه می باشد ضمن این که جمعیت ماهیان غیربومی رو به افزایش بوده که می تواند باعث افزایش سطح تروفی دریاچه گردد.